ChIP實驗超聲波破碎儀操作指南
做ChIP**步就是去確定超聲波破碎儀的參數(shù)設(shè)定，由于設(shè)備品牌不同，各項參數(shù)設(shè)置都需要自己摸索，十分不便。故此依據(jù)經(jīng)驗提出以下幾點僅供參數(shù)，希望能給您帶來幫助。
1.片段長度，如果是只做ChIP-PCR的話在200-1000范圍內(nèi)都可以，因為這個長度便于擴增，而ChIP-seq就得在200-500之間，這個范圍便于測序。
2.超聲能量，需要做幾個梯度（如振幅10%-60%，或功率100W-400W），從小到大去測試，太小不能充分打斷，太大則過度打斷，甚至?xí)^熱、起泡。
3.超聲時間，你需要做幾個梯度（如1min-5min），這個是指超聲總時間，不包括間隔。不要超聲過久過度產(chǎn)熱，會使你的蛋白變性或起泡，因為溶液里有表面活性劑SDS。
4.間隔時間，目的是讓之前單次超聲產(chǎn)生的熱量冷卻下來，10s-2min不等，一般不比單次超聲時間短
5.注意事項：a建議*好體積不要太小，否則探頭容易碰壁或離開液面，散熱也不夠好；b 整個超聲過程*好在冰水混合浴中進行，道理如前； c用1.5ml的Ep管超聲不易起泡。
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